巴依托海乡位于县城东南，乡机关距吉里于孜镇56公里，省道315线纵贯其东。东隔喀什河与萨木于孜乡相望，南濒伊犁河，西接英塔木乡，北连维吾尔玉其温乡。东西最宽11公里，南北最长13.5公里，总面积141.34平方公里。辖12个村民委员会，18个自然村，46个村民小组，2791户，13815人，劳力4299人，总人口中男7581人，女6234人，非农业人口547人，未落户的常住人口226人。有维吾尔、汉、回等12个民族，其中维吾尔族7801人，占56.5%，汉族3278人，占24%、回族1261人，占9%、东乡族891人、占6.5%，哈萨克族495人、占3.6%；余为乌孜别克、撒拉、俄罗斯、土、壮、柯尔克孜等族。

新中国成立初定名八区八乡，1952年6月改制为四区八乡，1954年改称五区七乡，1958年改为天山公社四大队，1972年析置为巴依托海公社，辖5个大队。1984年撤社建乡，沿用公社名称。党政机关驻塔依尔于孜村南。

该乡地处喀什河西岸冲积—洪积平原，海拔650—760米，全境分平原区和伊犁、喀什两河漫滩两大部分，地势平坦，水源充足，属团结渠灌区、水利设施完善。河滩低价地生长着河柳、胡杨、小沙枣等次生林及草本植物，是良好的天然牧场，为发展农牧业提供了优越条件。辖区平均气温8.5℃，年降水量340毫米，无霜期164天。经济以农为主，农牧并举，工副、运输、修理、餐饮、商业都有较大发展。

“巴依托海”系突厥语，意为“宣绕的灌木丛”，史书称“巴依图海”、“巴尔托辉”，其范围包括今巴依托海和英塔木两乡。